广州市基督教三自爱国运动委员会成立于1955年,是全市基督徒的爱国组织。1950年6月7日,广州基督教抗美援朝三自革新运动委员会成立,后改称广州基督教三自爱国运动委员会(简称三自会)。1981年2月,广州市基督教协会(简称市基协)成立。广州市基督教三自爱国运动委员会和广州市基督教协会并称为“广州市基督教两会”,实行合署办公。
目前,全市登记开放基督教活动场所40处。